Генетический анализ показал, что нужно для естественного контроля ВИЧ-инфекции

В ходе международного исследования человеческого генома людей, которые контролируют течение ВИЧ-инфекции, не обращаясь к помощи лекарств, ученые обнаружили несколько аминокислот, которые, судя по всему, помогают человеку успешно справляться с вирусом иммунодефицита. Эти аминокислоты помогают понять, как иммунная система человека распознает клетки, инфицированные ВИЧ.

Эти открытия, возможно, будут способствовать созданию вакцины против СПИДа или новых методов лечения для инфицированных людей, - заявил Брюс Уокер, исследователь из Медицинского института Говарда Хьюза при Массачусетском Главном Госпитале. Он также является профессором медицины в Гарвардской медицинской школе и директором Института Рагона при Массачусетском Главном Госпитале, Массачусетского технологического института и Гарварда.

Уокер и его коллега Флоренсия Перейра проводят международное исследование механизмов, сдерживающих ВИЧ, – глобальное исследование с целью понять, как малая часть людей-носителей ВИЧ, никогда не подвергавшихся лечению, умудряются справляться с вирусом за счет одной только своей иммунной системы. Уокер и его коллеги называют таких людей элитой, контролёрами ВИЧ. В их организме содержится менее 50 частиц вируса на один миллилитр крови; у людей, проходящих лечение - от 50 до 2000 частиц; у людей, которые не принимают лечение, таких частиц миллионы.

Где-то один из 300 инфицированных ВИЧ умудряется сохранять количество копий вируса в крови на низком уровне без лекарств, некоторые заболевают СПИДом в течение 6 месяцев с момента заражения. «Многие пациенты годами спрашивали своих врачей, почему их друзья заболевают, а они нет», - говорит Уокер, добавляя, что этим людям было предложено поучаствовать в проводимом им международном исследовании.

Первое исследование таких людей на уровне генома, опубликованное в интернете 4 ноября 2010 на сайте Science Express, - результат сотрудничества с сотнями клиник и институтов по всему миру, целью которого было найти подобных контролёров и провести анализ их крови.

В середине 1990-х Уокер с коллегами впервые узнали о существовании ВИЧ-контролёров, когда стало известно, что небольшая часть инфицированных людей остаются здоровыми. В начале 2000-х годов ученые осознали, что, хотя таких людей и мало, все же их достаточно, чтобы провести с их участием исследование и выяснить, как их иммунная система реагирует на вирус. В 2006 году, используя пожертвования филантропов Марка и Лизы Шварц, команда Уокера начала использовать результаты Международного проекта Hapmap (International Hapmap Project), целью которого было разобраться в генетических отличиях людей, чтобы проанализировать геномы ВИЧ-контролёров и прогрессоров (которые реагируют на вирус схоже). Исследовались люди европейского, афро-американского и испанского происхождения.

В настоящем исследовании команда Уокера провела исследование геномов, сравнив ДНК 974 ВИЧ-контролёров и 2648 человек с типичным течением заболевания. Этот анализ включал в себя около 1 миллиона вариантов (однонуклеотидных позиций в геномной ДНК, SNP) в каждом объекте и обнаружил свыше 300 таких однонуклеотидных позиций, ответственных за контроль над ВИЧ. Все они принадлежали хромосоме 6. Она содержит так называемые гены HLA-класса, которые отвечают за производство важных молекул иммунной системы, содержащихся в большинстве клеток тела. Молекулы HLA захватывают частицы белков, производимых вирусом во время его вторжения, и помещают их фрагменты на поверхности клетки, чтобы другие клетки могли распознать и уничтожить инфицированные клетки.

Ранее уже предполагалось, что гены HLA могут быть связаны с тем, насколько успешно организм борется с ВИЧ. Удивительно то, что помимо этих участков больше нигде не были найдены гены, помогающие контролировать вирус иммунодефицита. По словам Уокера, это хорошо, так как можно сосредоточиться на том, что на самом деле важно.

Чтобы полностью разобраться в теме, необходимо глубоко изучить геном человека на обозначенном выше участке и выяснить причинно-следственные связи. С помощью ранее опубликованных данных о HLA и вычислительной модели, разработанной студентом-медиком, входившим в исследовательскую группу, группе удалось точно определить, были ли варианты генов связаны с контролем либо недостатком контроля над ВИЧ. «Когда мы это сделали, это было словно посмотреть на проблему в сфокусированный микроскоп», - говорит Уокер. В частности, 6 разных аминокислот (5 из которых находились там, где пептид HLA взаимодействует с вирусными частицами), похоже, имеют значение для контроля над ВИЧ.

Некоторые аминокислоты содержатся в одном из подклассов HLA – подклассе HLA-B, и Уокер подозревает, что они влияют на то, как Т-клетки воспринимают пептид, что вызывает активацию Т-клеток, которые распознают и уничтожают инфицированные клетки.

Новые результаты помогли увидеть, что представляет собой эффективная естественная реакция иммунной системы и как она приводится в действие. Хотя ученые по-прежнему далеки от создания эффективной вакцины против ВИЧ, Уокер надеется использовать эту информацию, чтобы создать вакцину, которая будет заставлять иммунную систему более эффективно реагировать на ВИЧ и бороться с ним.

Howard Hughes Medical Institute

www.u-hiv.ru

Реклама: Мы успешно занимаемся созданием и продвижением сайтов в Екатеринбурге с 2006 г. - Мозжерин.РФ